Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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