Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms