Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK4P11802 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK4P11802 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms