Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms