Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms