Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VARSP26640 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VARSP26640 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VARSP26640 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms