Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms