Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms