Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF487B1APH4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms