Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms