Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACS2Q86VP3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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