Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms