Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT3P12035 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT3P12035 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT3P12035 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT3P12035 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms