Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BCKDKO14874 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BCKDKO14874 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BCKDKO14874 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BCKDKO14874 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BCKDKO14874 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BCKDKO14874 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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