Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms