Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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