Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms