Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF30P17039 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF30P17039 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF30P17039 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.5 ms