Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHBP55084 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHBP55084 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HADHBP55084 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms