Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIKFYVEQ9Y2I7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms