Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNQ9UQP3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms