Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SATB2Q9UPW6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms