Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LQ9UL33 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms