Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA9Q9UGM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA9Q9UGM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms