Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHRNA9Q9UGM1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHRNA9Q9UGM1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNA9Q9UGM1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA9Q9UGM1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNA9Q9UGM1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNA9Q9UGM1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHRNA9Q9UGM1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA9Q9UGM1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHRNA9Q9UGM1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA9Q9UGM1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CHRNA9Q9UGM1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA9Q9UGM1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA9Q9UGM1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNA9Q9UGM1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA9Q9UGM1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA9Q9UGM1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA9Q9UGM1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA9Q9UGM1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA9Q9UGM1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA9Q9UGM1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA9Q9UGM1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA9Q9UGM1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA9Q9UGM1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA9Q9UGM1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA9Q9UGM1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA9Q9UGM1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA9Q9UGM1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA9Q9UGM1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA9Q9UGM1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA9Q9UGM1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA9Q9UGM1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA9Q9UGM1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA9Q9UGM1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA9Q9UGM1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA9Q9UGM1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA9Q9UGM1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA9Q9UGM1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA9Q9UGM1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA9Q9UGM1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA9Q9UGM1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA9Q9UGM1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA9Q9UGM1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA9Q9UGM1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA9Q9UGM1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA9Q9UGM1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA9Q9UGM1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA9Q9UGM1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA9Q9UGM1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA9Q9UGM1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA9Q9UGM1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA9Q9UGM1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA9Q9UGM1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA9Q9UGM1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA9Q9UGM1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA9Q9UGM1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA9Q9UGM1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA9Q9UGM1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA9Q9UGM1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA9Q9UGM1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA9Q9UGM1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA9Q9UGM1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA9Q9UGM1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA9Q9UGM1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA9Q9UGM1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA9Q9UGM1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA9Q9UGM1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA9Q9UGM1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA9Q9UGM1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA9Q9UGM1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA9Q9UGM1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA9Q9UGM1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA9Q9UGM1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA9Q9UGM1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA9Q9UGM1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA9Q9UGM1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA9Q9UGM1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA9Q9UGM1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA9Q9UGM1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA9Q9UGM1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA9Q9UGM1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA9Q9UGM1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA9Q9UGM1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA9Q9UGM1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA9Q9UGM1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA9Q9UGM1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA9Q9UGM1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA9Q9UGM1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA9Q9UGM1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA9Q9UGM1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNA9Q9UGM1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNA9Q9UGM1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNA9Q9UGM1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNA9Q9UGM1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms