Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM10Q9UDY6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM10Q9UDY6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms