Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-18Q9QC07 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVK-18Q9QC07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms