Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM140Q9NV12 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms