Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPMQ9NSP4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPMQ9NSP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms