Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRIP3Q9NQ35 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms