Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 635.1 ms