Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNDIG1Q9H7V2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms