Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAF1Q9H7N4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAF1Q9H7N4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms