Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP4Q9H6H4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP4Q9H6H4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms