Protein–RNA interactions for Protein: Q9H511

KLHL31, Kelch-like protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL31Q9H511 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL31Q9H511 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL31Q9H511 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL31Q9H511 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms