Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKNK1Q9BUB5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms