Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
MKNK1Q9BUB5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MKNK1Q9BUB5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
MKNK1Q9BUB5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MKNK1Q9BUB5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MKNK1Q9BUB5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MKNK1Q9BUB5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
MKNK1Q9BUB5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MKNK1Q9BUB5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MKNK1Q9BUB5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MKNK1Q9BUB5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MKNK1Q9BUB5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MKNK1Q9BUB5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MKNK1Q9BUB5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MKNK1Q9BUB5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MKNK1Q9BUB5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MKNK1Q9BUB5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MKNK1Q9BUB5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MKNK1Q9BUB5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MKNK1Q9BUB5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MKNK1Q9BUB5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MKNK1Q9BUB5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MKNK1Q9BUB5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MKNK1Q9BUB5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MKNK1Q9BUB5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MKNK1Q9BUB5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MKNK1Q9BUB5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MKNK1Q9BUB5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MKNK1Q9BUB5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MKNK1Q9BUB5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MKNK1Q9BUB5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MKNK1Q9BUB5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MKNK1Q9BUB5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MKNK1Q9BUB5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MKNK1Q9BUB5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MKNK1Q9BUB5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MKNK1Q9BUB5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MKNK1Q9BUB5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MKNK1Q9BUB5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MKNK1Q9BUB5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MKNK1Q9BUB5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MKNK1Q9BUB5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MKNK1Q9BUB5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MKNK1Q9BUB5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MKNK1Q9BUB5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MKNK1Q9BUB5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MKNK1Q9BUB5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MKNK1Q9BUB5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MKNK1Q9BUB5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MKNK1Q9BUB5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MKNK1Q9BUB5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MKNK1Q9BUB5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MKNK1Q9BUB5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MKNK1Q9BUB5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MKNK1Q9BUB5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MKNK1Q9BUB5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MKNK1Q9BUB5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MKNK1Q9BUB5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MKNK1Q9BUB5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MKNK1Q9BUB5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MKNK1Q9BUB5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MKNK1Q9BUB5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MKNK1Q9BUB5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MKNK1Q9BUB5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MKNK1Q9BUB5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MKNK1Q9BUB5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MKNK1Q9BUB5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MKNK1Q9BUB5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MKNK1Q9BUB5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MKNK1Q9BUB5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MKNK1Q9BUB5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MKNK1Q9BUB5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MKNK1Q9BUB5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MKNK1Q9BUB5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MKNK1Q9BUB5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MKNK1Q9BUB5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MKNK1Q9BUB5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MKNK1Q9BUB5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
MKNK1Q9BUB5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MKNK1Q9BUB5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MKNK1Q9BUB5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
MKNK1Q9BUB5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MKNK1Q9BUB5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MKNK1Q9BUB5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MKNK1Q9BUB5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MKNK1Q9BUB5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MKNK1Q9BUB5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MKNK1Q9BUB5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MKNK1Q9BUB5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MKNK1Q9BUB5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
MKNK1Q9BUB5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MKNK1Q9BUB5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MKNK1Q9BUB5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MKNK1Q9BUB5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MKNK1Q9BUB5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MKNK1Q9BUB5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MKNK1Q9BUB5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MKNK1Q9BUB5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MKNK1Q9BUB5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MKNK1Q9BUB5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms