Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPAT1Q99943 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms