Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORT1Q99523 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms