Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PANX1Q96RD7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms