Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHAMP1Q96JM3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms