Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC41A3Q96GZ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC41A3Q96GZ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms