Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APIPQ96GX9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 832 ms