Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEURL3Q96EH8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEURL3Q96EH8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEURL3Q96EH8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEURL3Q96EH8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEURL3Q96EH8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEURL3Q96EH8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEURL3Q96EH8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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NEURL3Q96EH8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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NEURL3Q96EH8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEURL3Q96EH8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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NEURL3Q96EH8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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NEURL3Q96EH8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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NEURL3Q96EH8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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NEURL3Q96EH8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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NEURL3Q96EH8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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