Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM19Q96E16 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms