Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF653Q96CK0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms