Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4CQ96CF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms