Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAMF9Q96A28 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAMF9Q96A28 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms