Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HGDQ93099 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HGDQ93099 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HGDQ93099 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HGDQ93099 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HGDQ93099 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HGDQ93099 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HGDQ93099 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HGDQ93099 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HGDQ93099 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HGDQ93099 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HGDQ93099 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HGDQ93099 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HGDQ93099 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HGDQ93099 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HGDQ93099 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HGDQ93099 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HGDQ93099 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HGDQ93099 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HGDQ93099 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HGDQ93099 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HGDQ93099 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HGDQ93099 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HGDQ93099 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HGDQ93099 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HGDQ93099 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HGDQ93099 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HGDQ93099 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HGDQ93099 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HGDQ93099 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HGDQ93099 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HGDQ93099 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HGDQ93099 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HGDQ93099 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HGDQ93099 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HGDQ93099 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HGDQ93099 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HGDQ93099 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HGDQ93099 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HGDQ93099 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HGDQ93099 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HGDQ93099 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HGDQ93099 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HGDQ93099 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HGDQ93099 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HGDQ93099 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HGDQ93099 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HGDQ93099 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HGDQ93099 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HGDQ93099 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms