Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms